Yazar "Yozlu, Medinenur" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    TNFRSF13B VARYANTLARI, YAYGIN DEĞİŞKEN İMMÜN YETMEZLİK KLİNİK FENOTİPİNİN DÜZENLENMESİNDE ROL OYNAR
    (Istanbul University, 2023) Fırtına, Sinem; Kutlu, Aslı; Işıkgil, Begüm; Yozlu, Medinenur; Çepeci, Beyza Nur; Yılmaz, Hülya; Ng, Yuk Yin
    Amaç: TNF reseptör üst ailesi üyesi 13B (TNFSRF13B), B hücre olgunlaşması, plazma hücresi farklılaşması ve antikor yanıtı için kritik olan TNF üst ailesinin bir üyesidir. TNFRSF13B geninin bozulmuş ifadesi, yaygın değişken immün yetmezlik (YDİY), otoimmünite ve lenfoproliferasyon bozuklukları ile ilişkilendirilir. Bu genin hastalığa neden olan varyantlarının yanı sıra bazı farklı izoformlarınında B hücre yanıtını değiştirdiği gösterilmiştir. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, 68 YDİY hastası yeni nesil dizileme yöntemi ile taranarak TNFRSF13B geninde 26 varyant (üç sinonim, beş yanlış anlamlı, on bir UTR ve yedi intronik varyant) saptanmıştır. Tespit edilen varyantlar etkilerine göre biyoinformatik araçlar ile modellenmiş, etkili olduğu gösterilen varyantların klinik bulgular ile ilişkisi araştırılmıştır. Bulgular: Saptanan varyantların (15/26) %58’i, transkripsiyon faktörü ya da miRNA bağlama bölgeleri, kırpılma bölgeleri veya protein üzerinde termodinamik etkisi olabileceği gösterilen varyantlardır. Biyoinformatik olarak kırpılma bölgesini değiştirdiği düşünülen varyantlara sahip hastalarda, diğer hastalara göre anlamlı derecede düşük IgA düzeylerinin (p=0,009), otoimmünite varlığının (p=0,02) ve gastrointestinal bulgular (p=0,05) gibi YDİY fenotipinde görülen bulguların olduğunu gözlemledik. Ayrıca c.*79A>G 3-UTR varyantının düşük IgA ve IgE seviyeleri ile ilişkili olduğu bulunmuştur. Global veritabanlarına kıyasla on üç varyantın en az on kat artmış alel frekanslarına sahip olduğu bulundu. Bu fark potansiyel düzenleyici etkiye sahip TNFRSF13B varyantlarının YDİY hastalarında daha yaygın olduğunu göstermektedir. Sonuçlar: Bu bulgular, TNFRSF13B’deki varyantların YDİY fenotipini açıklamasa da, kırpılma bölgesini değiştirme potansiyeli olan varyantların YDİY’in altında yatan genetik arka plandan bağımsız olarak hastaların patogenezine katkıda bulunabileceğini göstermiştir.